2022年クリスマスイブ、グレゴリオ聖歌の旋律を正確に繰り返し歌うザトウクジラが発見され、このクジラの遺伝子解析から、人類はついに不老不死に関わる遺伝子を特定する。
それから100年後。あらゆる階層において棲み分けが完成し、「理想社会」と呼ばれていた日本。 分断された最下層区域である「新出島」から、アキラという一人の少年が、脱出をはかろうとしていた。アキラは、処刑されることになった父から、不老不死遺伝子に関する重要な秘密を託されたのだった。秘密情報を書き込んだチップを体内に埋め込み、最上層施設に住むある人物に届けるための、アキラの旅がはじまった…...